SCMCP - MCP服务，MCP服务器，MCP教程

基本能力

产品定位

SCMCP是一个专为单细胞RNA测序（scRNA-Seq）分析设计的MCP服务器，通过自然语言处理简化分析流程。

核心功能

• IO模块：支持用自然语言读取和写入scRNA-Seq数据。
• 预处理模块：包括过滤、质量控制、标准化、缩放、高变基因筛选、PCA分析、邻居分析等。
• 工具模块：支持聚类分析、差异表达分析等功能。
• 绘图模块：提供小提琴图、热图、点图等可视化工具。
• 细胞间通讯分析：支持细胞间通讯的深入分析。

适用场景

• 研究人员和开发者需要进行scRNA-Seq分析的场景。
• 需要集成scanpy功能的AI客户端、插件或代理框架。

使用教程

使用依赖

确保已安装Python环境。

安装教程

1. 通过PyPI安装SCMCP：
   bash
pip install scmcp
2. 运行测试：
   bash
scmcp run

调试方式

• 本地运行：在MCP客户端配置如下：
  json
"mcpServers": {
"scmcp": {
"command": "scmcp",
"args": ["run"]
}
}
• 远程运行：在服务器上运行：
  bash
scmcp run --transport sse --port 8000
  然后在MCP客户端配置：
  http://localhost:8000/sse